Acesse no menu CONFIG > FILIAIS
Selecione a NOVA FILIAL que receberá os produtos, acesse a guia 
Vá até a opção "COPIAR PRODUTOS DE OUTRA FILIAL" e selecione de qual filial os produtos serão copiados:
E depois clique no botão 
Obs: Depois de confirmada a operação ela é IRREVERSIVEL!