Abra o sincronizador, certifique-se que o cartão e leitora estão corretamente conectados, faça um teste comunicação, clique em 
e depois
Se estiver tudo correto com o sincronizador ele irá retornar a mensagem:
Caso retorne o ERRO:
Verifique o seguinte:
- Se a leitora e cartão do certificado estão conectados corretamente, se estiver, retire e coloque novamente, reinicie o computador e faça um novo teste
- Talvez o certificado esteja vencido
- Ou o certificado não está instalado
Se o erro persiste avise o suporte.